La station nationale est implantée à Chemillé, siège de l'association, située en région Pays de la Loire, dans l'environnement de VEGEPOLYS, pôle de compétitivité de référence sur le végétal spécialisé respectueux de l'environnement et de la santé, . Elle y regroupe, sur un site irrigué de 12 ha, terrains d'expérimentation et bâtiments (bureaux, laboratoires, centre documentaire, locaux techniques spécialisés, serres) et héberge les équipements nécessaires en matière d'expérimentation, d'analyses phytochimiques, de collecte et de traitement de l'information.

La station Sud-Est, module spécialisé pour les plantes aromatiques et à parfum et pour l'agriculture biologique est hébergée au CEVR (Centre Expérimental de la Vallée du Rhône), près de Montélimar dans la Drôme sur un site de 5 ha. Elle met en synergie les actions respectives de l'iteipmai et de ses partenaires locaux dans les régions Rhône-Alpes et Provence-Alpes-Côte d'Azur.