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GENOLAVANDE - à retenir |
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Développement d'outils génomiques permettant la caractérisation et la sélection des variétés de lavande. |
CASDAR « Semences et Sélection Variétale » Date : 2018 / 2020
Mots clés Lavande, création variétale, génomique, marqueurs
Chef de projet iteipmai, Institut Technique Interprofessionnel des Plantes à Parfum, Médicinales et Aromatiques
Coordination iteipmai
Contacts Guillaume Frémondière (iteipmai) Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser. Benjamin Lemaire (iteipmai) Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser. Partenaires techniques
Partenaires financiers
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LE PROJET
Contexte L’iteipmai travaille depuis de nombreuses années sur la création variétale lavande avec des succès en terme de rendement et de qualité car les 3 variétés populations iteipmai Rapido, Carla et Saralia (en début de développement) représentent environ la moitié des surfaces lavandes et la totalité des surfaces de Lavande population. Bien que les géniteurs de ces variétés synthétiques aient été choisis pour leur apparente tolérance au Stolbur, elles ne répondent pas encore aux exigences de la production. Le dépérissement reste un problème complexe à travailler sur le plan génétique, il manque des outils pour développer des variétés innovantes et résistantes. Pour cette raison, l’iteipmai a lancé le programme Génoparfum (CASDAR RT, lauréat 2015) en collaboration avec l’INRA EPGV, le CRIEPPAM et Végépolys. Ce programme a permis de séquencer les parties codantes du génome (Unigene puis Genespace) des lavandes Maillette et Diva et du lavandin Grosso et d’identifier plus de 30 000 SNP sur 8 000 gènes dont la fonction codante a été validée par comparaison avec des bases de données mondiales. Ces données ont ensuite été utilisées pour séquencer les ADN d’une collection de lavandes . Afin de valoriser ce programme et dans le but d’identifier les gènes intervenant dans la tolérance au Stolbur, il est nécessaire de prolonger ce travail sur les outils moléculaires. Objectifs
Moyens :
- Création d’une collection d’étude - Clonage de la collection d’étude - Phénotypage de la collection d’étude « adulte » - Phénotypage des collections d’étude « jeunes » - Génotypage de la collection d’étude sur la base de marqueurs SNP pour l’analyse de la structuration génétique et les études de génétique d’association dans cette collection - Etude d’association par une approche gène candidat pour l’identification de gènes impliqués dans les caractères d’intérêt majeur pour la lavandiculture
- Etablissement d’une carte génétique du génome de la lavande - Mise au point d’une méthode de croisement contrôlé de la lavande
Résultats:
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DOCUMENTS A TELECHARGER
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