Objectif général

Le stagiaire aura en charge :

• La réalisation des notations en cours de culture
• Le prise en charge du chantier de récolte (appuyé par les équipes techniques)
• La distillation des huiles essentielles et l’envoi au laboratoire d’analyses phytochimiques
• L’analyse des données acquises en 2023 (agronomiques et phytochimiques)
• L’intégration des données de 2022 et 2023 pour identifier les meilleurs clones à utiliser pour la suite du programme
• La rédaction du rapport d'essai

CV et lettre de motivation à envoyer à l’adresse e-mail This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

Merci de préciser l'intitulé du stage dans l'objet du mail.

Encadrante

Responsable du stage

Christelle Garnier, Chargée d’expérimentation

Berline Fopa Fomeju, Responsable Ressources génétiques

Objectif général

La camomille romaine (Chamaemelum noblie (L.) All) est une plante médicinale appartenant à la famille des Astéracées et dont l’huile essentielle est valorisée en santé, beauté et bien-être. En France, plus de 60 % des surfaces cultivées de camomille romaine sont localisées dans le Maine-Et-Loire. De plus, un seul cultivar, Flora pleno, est actuellement cultivé. Depuis quelques années, les productions régionales font face à plusieurs difficultés dont les principales sont une perte de la stabilité génétique du clone cultivé ainsi qu’un manque de concurrence de la culture vis-à-vis des adventices. Un de leviers possibles pour répondre à ces problématiques est de proposer à la filière du nouveau matériel génétique, plus vigoureux, et ayant un profil phytochimique adapté aux besoins du marché.

Accompagné/e d’un chargé d’expérimentation, le/la stagiaire aura en charge :

• La réalisation des notations en cours de culture (taux de mortalité, dates de floraison, hauteur à la récolte, récoltes...) sur 72 accessions (populations ou clones) installées sur une parcelle d’essai à Chemillé.
• La préparation des échantillons pour les distillations des fleurs récoltées pour l’analyse des teneurs et qualités des huiles essentielles.
• La participation aux croisements dirigés pour générer des nouvelles ressources génétiques
• L'analyse des résultats et la réalisation d'un rapport d'essai pour orienter le choix des accessions à utiliser pour la création de nouvelles variétés de camomille romaine, par rapport aux objectifs de sélection.

CV et lettre de motivation à envoyer à l’adresse e-mail

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• ITEIPMAI : L’iteipmai, Institut technique qualifié par le Ministère de l'Agriculture et affilié au Réseau ACTA, assure une mission de recherche appliquée finalisée au service des filières plantes à parfum aromatiques et médicinales (PPAM). Cette activité technique majeure, réalisée à la demande de ses adhérents -acteurs de la production et industriels utilisateurs- a pour finalité d’améliorer le revenu des agriculteurs et de le sécuriser dans le temps, de maintenir et développer une activité des PPAM sur le territoire, de permettre à l’agriculture et aux entreprises industrielles d’accéder ensemble à un développement durable, de générer la confiance et le bien-être des consommateurs. Il est spécialisé et expert dans les domaines suivants : (i) la création variétale, (ii) l’amélioration des itinéraires de culture et la lutte contre les bioagresseurs, (iii) l’optimisation de la production de métabolites secondaires des plantes, (iiii) la valorisation de ces métabolites secondaires dans l'industrie
• AGROOF : AGROOF est une Société COopérative et Participative spécialisée dans l‘étude et le développement des systèmes agroforestiers en France depuis 2000. Pour cela elle réalise des formations techniques, accompagne des projets agroforestiers et mène des travaux de recherche et de développement en partenariats avec des organismes de recherche, des organismes techniques et des agriculteurs. Elle s‘implique également dans l‘évolution des réglementations concernant la prise en compte de l’arbre en contexte agricole.

• Caractériser les effets des aménagements AF sur les performances agronomiques des PPAM (sarriette, romarin, thym) et évaluer l’effet d’un ombrage et du microclimat sur la contrainte hydrique et la mortalité des PPAM (Action 2)
• Approfondir les connaissances de l’effet des aménagements arborés sur la diversité et l’activité des lombriciens, indicateurs de la qualité des sols (Action 3)
• Étudier l’effet des pratiques AF sur les principaux bio-agresseurs et leurs ennemies naturels en SAF PPAM (Thym, sarriette, romarin) (Action 3)
• Acquérir et produire des référentiels technico-économiques sur ces systèmes (Action 4)
• Favoriser les échanges de connaissances par des journées de rencontres inter-métiers et la mise en place de nouvelles méthodes pédagogiques privilégiant le contact entre apprenants et les acteurs du projet (Action 5)

Missions confiées

• Bibliographie sur l’agroforesterie à PAM (et autres) en France et ailleurs en Europe, ainsi que le comportement des plantes destinées à l’herboristerie dans différentes conditions abiotiques - Réalisation d’un état de l’art.
• Développement de protocoles de suivis portant sur la croissance, le développement, la vigueur, l’état sanitaire et l’état hydrique des cultures de PPAM, ainsi que sur les rendements et la qualité en huile essentielle.
• Mise en place d’un dispositif de caractérisation des conditions d’ombrage et du microclimat.
• Suivi de sites pilotes avec aménagements agroforestiers intraparcellaires développés
• Analyses statistiques de résultats.

Nous recherchons une personne motivée pour travailler dans une petite équipe, intéressée par l’expérimentation et la recherche, autonome et faisant preuve d’initiative tout en restant transparente et ouverte à l’échange avec l’équipe en charge de l’étude.

Sont souhaitées, les compétences suivantes :

• Des connaissances en PPAM
• Des connaissances en agroforesterie sont un petit plus
• Capacité d’analyse de la littérature scientifique
• Un intérêt pour l’expérimentation et le goût du terrain
• Une certaine rigueur scientifique est attendue
• Capacité de synthèse et de rédaction
• Maitrise de R

Le ou la future stagiaire pourra développer ses connaissances et compétences sur de nombreux aspects auxquels touche le stage, et travailler en lien avec les agriculteurs et l’équipe du projet.

Permis B nécessaire

Le stage sera basé à Montboucher sur Jabron et encadré par Benjamin Lemaire (ITEIPMAI) et Camille Béral (AGROOF SCOP). Un comité de suivi sera également constitué, incluant l’INRAE UMR PIAF (Stéphane Herbette), et les agriculteurs des sites.

Denis BELLENOT Responsable du pôle Phytochimie et Normalisation.

Objectif général

La dérivatisation par oximation-silylation permet d’établir des profils GCMS d’extraits polaires utilisables en métabolomique. La méthode actuellement utilisée au laboratoire est manuelle avec plusieurs étapes. Nous voulons automatiser cette méthode pour économiser du temps, gagner en reproductibilité et pouvoir passer en mode quantitatif.

Les missions principales du stage sont :

• S’intégrer à l’équipe du laboratoire (1 ingénieure + 4 techniciennes polyvalentes)
• Prendre en main l’appareil de GCMS et son automate
• automatiser la méthode de dérivatisation
• tester la robustesse de cette adaptation
• mettre en place les conditions de quantification
• constituer une base de données interne (spectres de masse et indices de rétention) de substances de références
• tester/valider cette méthode sur une famille d’alcaloïdes à fonction ester

En fonction des résultats obtenus, d’autres missions pourront être confiées permettant l’accès à l’ensemble du parc analytique du laboratoire